崇祯十六年十月，媺娖率凰羽卫抵达重庆。此时重庆城外除了大都督府3万将士和3千白杆兵外，还汇集了数十支缙绅团练，加起来也有三四万人。
她与陈永华、秦良玉相互见礼后，陈永华向媺娖引见了李定国。
李定国被俘后本来誓死不降，没想到他的部下带来消息说张献忠怀疑他投降明军，将他全家老小杀的一干二净，连他的旧部都要斩草除根。李定国痛哭泣血，遂投诚大都督府，誓要报此大仇。
明军一路进军如此顺利，也跟张献忠自毁栋梁、人人自危有关。
次日一早，媺娖挥师攻城。此来攻川，因为蜀道艰险，只运来了一些8磅炮，但也足够完成冷兵器时代的攻城任务了。
媺娖先让天雄军的长枪兵行进到对方的弓弩射程边缘，让火枪手对城头实施连绵压制，然后推出大炮，对准重庆城门一阵猛轰。木制的包铁城门在炮弹的打击下四分五裂向后倒去，天雄军将士一声欢呼，列阵入城。
城中的贼兵一度打算用巷战的方法挽回战局，但在明军枪阵火器的打击下，没多久就全军崩溃。艾能奇和刘文秀见大势已去，率领残军逃回成都。
张献忠见两人丢了重庆，只带了数千残军逃回成都，不由大怒，便要下令将这两人斩首。所幸殿上文武一起劝阻，大家眼见孙可望自立，李定国降敌，若是再杀了这两位，那么大西就没有一个可战之将了。
张献忠半晌也自醒悟，将两人狠狠责骂一番，仍令他们统帅部队。只是如今重庆一失，成都已是无险可守。川中各州府见大西大势已去，士绅百姓纷纷揭竿而起，击杀大西兵士，向大都督府输诚。整个大西王朝瞬间就陷入了风雨飘摇之中。
数日后，明军收复绵竹。眼见成都的最后一层屏障也已失去，大西君臣上下也不免要思考下何去何从。
面对来势汹汹的天雄军，若是几年前的张献忠，一定毫不犹豫，拉起人马就逃。可是这两年他已经习惯了荒淫奢侈的生活，却不想再去吃苦，便自欺欺人地认为自己一定可以死守成都。
张献忠下令用砖石砌死了成都的城门，同时为了防止城内百姓勾结明军，又下令屠城，只留下年轻少女作为营妓。他又疑心部下背叛，连杀了不少文武官员，直到再也没人敢去见他。
此时张献忠精神已经不太正常，整日据坐大殿，指挥兵士**杀戮女子为乐。这些大西军士知道自己时日无多，便趁机在临死前发泄最后的疯狂。成都城内到处都是兵士成群结伙，烧杀淫掠，有时两伙兵士相遇，便互相厮杀。一时成都城又变成了炼狱一般。
当媺娖率领大军来到成都城下时，只见城中烟火不绝，城头空空荡荡，连个守城的大西军都没有，不由愕然。派出部队去打城门，却发现城门已被砌死。
媺娖唤来兵士，安排用火药炸门。只听一声巨响，城口烟雾弥漫。片刻后烟雾散去，却发现城门虽然开了一个大洞，但进出仍是不便。明军又炸了好几次，方才炸出一条可容大军进入的通道，整军进城。
大军进入成都，却被眼前景象震撼。成都本是一个人口数十万的大城，如今却是只剩一地残垣断壁，道路上尽是尸体残骸。不远处几个大西军正在凌辱一个女子，见了明军进城，发一声喊，一起逃走。
媺娖看了成都惨状，大怒下令，让天雄军封锁各处城门，分成若干小队清理街道，见到大西军，格杀勿论。明军将士看了眼前景象，都是义愤填膺，听了媺娖将令，纷纷大声应诺，挥军剿寇。
那些大西军不敢与明军交战，都是纷纷逃窜。只是各处道路都被封锁，明军拉网搜索，逐渐压缩空间，将那些大西军逼到一处。不论那些人是悍然反抗，还是跪地求饶，都是一轮排枪送上。
这些大西军或许有一些本是饥民，不得已而造反，但进入大西军之后，整日烧杀淫掠，却把心底深处的一丝良知抛得一干二净。这些人也不知屠过多少城池，今日终于被天雄军屠到自己头上，正所谓天道循环、报应不爽。
媺娖安排部下去清理大西余孽，自己带了凰羽卫向昔日的蜀王府、今日的大西宫走去，众将紧随其后。沿途见有零星贼众，便有凰羽卫将士上前绞杀。媺娖毫不停顿，直往王府而去。
到了门前，却见一队贼兵发一声喊，四散奔逃。媺娖也不理会，交给凰羽卫和天雄军清剿，自己隔空一挥，一股大力涌到，便将王府大门向两侧推开。媺娖停步数息，感知里面并无埋伏，举步向前，直往府中心而去。
沿路穿廊过阁，只见画栋雕栏，假山花树之间，却散布着无数**的年轻女尸，不少尸体肢体残缺，死前显是受过极惨折磨。媺娖压抑心中怒气，用心查探周围，感知到远处花园处有一人停留，便向那里行去。
众人走进花园，却被眼前的景象吓了一跳。只见张献忠浑身浴血，满地都是女尸，尸体的双足都被斩下，堆成了一座假山，张献忠手持长刀，站在山前狂笑。
众人都是武功高强，执掌一方的豪杰，见了如此诡异的情景，却是不免毛骨悚然。陈圆圆站在媺娖身边，心中害怕，便伸手挽住媺娖手臂，缩到了她的身后。
张献忠听到人声，转身回头，看到众人进来。他见到媺娖素衣赤足的天女仙姿，顿时呆愣片刻，随即大声呼道：“来人，快给朕斩下那女子的双足，作为山尖。”
何铁手闻言噗嗤一笑，笑着对媺娖道：“殿下，没想到居然有人舍得斩下你的小脚呢。”
媺娖轻蹙黛眉，拔出倚天剑，冷然道：“张献忠，你祸乱天下，因你而死的百姓不下百万。今日本宫替天行道，要为百姓报仇。”
张献忠闻言，仰天狂笑道：“朕乃真命天子，奉天命杀人。天生万物养于人，人无一物回于天，杀！杀！杀！杀！杀！杀！杀！”挥舞长刀，就向媺娖扑来。
媺娖一挑眉角，正要上前，旁边闪出李定国道：“末将与张贼有灭门血仇，请殿下让末将出手。”
媺娖收足笑道：“李将军请。”
李定国躬身行了一礼，转身拔刀，向张献忠迎去。两人身形交错，只听张献忠一声痛呼，长刀落地，右手已被李定国斩落。他极是凶悍，受此重创，仍是挥拳向李定国扑去。李定国长刀一挥，张献忠滚落地上，却是自己也尝了尝断足的味道。此刻他一手两足俱断，饶是他悍勇过人，也痛得在地上打滚。
李定国跨步上前，对他道：“你杀我全家一十七口，我本想斩你一十七刀。看在你我君臣一场的份上，那剩下的十四刀就免了，给你个痛快的吧。”长刀挥出，一颗头颅飞上半空。一代祸乱天下的巨寇，就此殒命。
张献忠既死，其余大西余孽只剩下孙可望一部盘踞云南。
媺娖任命陈永华为四川总督，令他率天雄军镇守四川，防御陕西流寇。升原四川总兵秦良玉为云贵总督，请她率军剿灭孙可望，秦良玉慨然奉命。任命刘国轩为湖广总督，率神机军镇守湖广，防御中原李自成和罗汝才部。升甘辉为靖东将军，领江西总兵。升李定国为安西将军，令其收拢余部，回南直整编。
消息传回两京，朝野震动。
江南半壁士绅百姓原本担心百万流贼来犯，如今三贼两逃一死，江南可以安享承平之乐，固是欢欣鼓舞，为大都督府贺。
北京朝野上下更是将此战当做是大明中兴的征兆。毕竟此战消灭了流匪主力，更是击杀了纵横多年的巨寇张献忠。因此在崇祯十七年的春节来临之际，京师上下无论达官贵人还是平民百姓倒都过了一个好年。
可惜似乎上天不想让大明轻松度过此关。
崇祯十七年春，中原大旱，李自成与罗汝才聚众数十万。这次他们不敢再打大都督府长平公主治下的主意，便合军再攻开封。
崇祯下令陕西总督孙传庭出师救援。孙传**疏回复道：“兵新募，不堪用。”但心急如焚的崇祯帝不加理会，只是逼迫孙传庭尽快救援开封。
孙传庭知道以新募之兵对阵流贼数十万之众，乃是必败之局，不由得顿足叹息：“奈何乎！吾固知往而不返也，然大丈夫岂能再度对狱吏乎！”他宁愿战死疆场，也不想再次因为抗旨去受牢狱之灾了。
他借鉴襄阳之战明军大胜的经验，为了增强明军的火力和防守能力，特地赶制了三千辆载有火铳的“火车”，这种“火车”行进时可抵御骑兵的冲击，驻扎时则可环阵拱卫。
李自成得知孙传庭率5万秦军出关赴豫，遂整军前去截击，中原大战，一触即发。
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