就在荷军的数十艘纵火船气势汹汹的冲向明军战舰时，郑森不慌不忙，安排五艘战列舰摆成了交叉队型迎战。
当荷军距离明军3000米时，就迎来了42磅和32磅加农炮的第一轮洗礼。荷军十几艘小船被击中，船上的火药被引燃，便如在海上点起十几个火炬一般。
荷军加速冲过火网，没多久又迎来了第二轮齐射。这次齐射由于离得更近，明军的射击更加精准，再加上18磅和9磅炮的加入，导致明军的火网更加密集。那些小船上本来就带了不少易燃之物，在明军霰弹攻击下，大多都被引燃爆炸。
只有寥寥几艘小船接近了明军军舰，但迎接他们的却是整齐的排枪。只有一艘火船的残骸撞到了经远号，但经远号水线上的铁皮护甲却断绝了荷军的最后一丝侥幸。郑森更是下令射杀了所有落水的荷军水手。
赤嵌城上的荷兰军士见了这一幕，都切齿咒骂明军野蛮残暴，却没有人敢再来海上送死了。
郑芝龙心中却是五味交集。刚才的这场战斗既显示爱子的指挥技巧，也展现了朝廷海军的狰狞爪牙。
他见了这场战斗之后，不由得假象了自己的郑家水师和第三舰队的交战过程。显然不论是接舷战还是纵火船，都会在靠近第三舰队战列舰前被送入海底。他心中不由升起了英雄迟暮之意，看来自己是该回乡养老了，所幸森儿深得公主信重，未来的郑家还是交给森儿吧。
这时战舰忽地一停，耳边传来了媺娖的声音：“郑将军，我军该登陆了。”郑芝龙回过神来，抱拳道：“殿下，登陆后请让末将打这头阵。”媺娖看他语气诚挚，便欣然应允。
明军大队在禾寮港登陆。郑森依照媺娖军令，指挥第三舰队为陆军提供舰炮压制。媺娖带了陈圆圆、何铁手和陶红英率三千凰羽卫登陆，同时郑芝龙浩浩荡荡的一万大军也上岸安营扎寨。
期间荷军发炮阻击，却吃了第三舰队几轮齐射，所有近海的炮台都被打哑。
当地百姓乡民这些年深受荷兰人欺压，箪食壶浆，前来迎接王师。媺娖派郑森率领第三舰队进入台江彻底切断赤嵌城与台湾城的联系，郑芝龙率本部将士进攻赤嵌城。
赤嵌城中描难实叮见识了第三舰队的火力之后立即派人向台湾城的总督揆一求救，这时有兵士报告说明军开始出营，有攻城迹象，连忙派人去找贝德尔上尉商议对策。
片刻之后，兵士回报说贝德尔上尉率领了400火枪兵出城迎战。描难实叮闻言大惊，他现在深深敬畏明军的火器威力，只想着固守城堡等待台湾城和巴达维亚来的援军。现在听到贝德尔冒然出城迎战，焦急愤怒之下，也只能跑到城头去观看战况了。
贝德尔原本也被明军战舰的炮火震慑，但当他看到郑芝龙的一万大军时，白人的自信又回来了。在他看来，这些手持刀盾长矛的步兵，只要来一轮齐射，自然崩溃。他没有征求描难实叮的同意，便自己带着城中的400火枪兵出城迎战，打算给明军一个当头痛击。
郑芝龙今日见了媺娖海军威势，特意抢了这个攻城的任务来，也是存了展示自家军势的意思。媺娖带了凰羽卫跟在后军观看。
见到荷军出击，郑芝龙部下上去迎战，哪知距离荷军还有100多米，荷军排枪放出，郑军倒下了几百兵士，其余士兵都是吓得逃回，
荷军士兵指手画脚，极是得意。有部下知道火枪装弹不易，呼道：“红毛鬼放了一枪，要上火药装铅子，大伙儿冲啊！”郑军冲到半路，荷军换好了子弹，又是一轮排枪，击杀了数百人。
郑军两阵下来，死伤五六百人，兵士畏惧荷兰火枪厉害，都不敢进攻。荷兰人毕竟人少，也不敢追击。两军竟成僵持之状。
郑芝龙看自家数千大军，被区区四百荷兰兵吓住，自觉在媺娖面前丢了人，正要组织敢死队冲锋，却被媺娖拦住。
媺娖笑着对陶红英说道：“荷兰人拿了些火绳枪就沾沾自喜，且让他们见识见识我大都督府的火器！”红英欢呼领命，只带了500凰羽卫上前。
对面荷兰兵看到明军换了一队美女上前，都感诧异。贝德尔笑着对左右说道：“看来大明帝国是想送些美女来慰劳慰劳我们了。”身边兵士都是**。
只见那些美女走到150米处，排成一排，举起了火枪对着自己。贝德尔灵机一闪，惊叫道：“该死！她们也是火枪兵，射程比我们远！快卧倒！”话音刚落，远处一阵枪响，荷兰阵地上血肉横飞。看着身边一地的死伤兵士，贝德尔心胆俱裂，喊道：“撤退！撤退！”剩余的荷兰士兵也顾不上受伤的伙伴，纷纷转身拼命的向赤嵌城逃去。
陶红英适才已经看出了荷兰火绳枪的射程只有100米，而凰羽卫的滑膛枪则有150米。因此她率领这些姑娘不紧不慢地保持在荷兰军身后120米左右处，悠闲地点杀荷兰军。这些荷兰军在挨了几轮齐射后纷纷崩溃，贝德尔还率了一些人企图向凰羽卫发动决死冲击，但无论是逃是战，这400荷军都死在了凰羽卫的枪下。
郑芝龙在远处看了这一幕，不禁心中大震。他的一万大军在这400荷兰兵前裹足不前，转眼间400荷兰兵又被500凰羽卫轻易射杀。想想大都督府麾下的三军一卫，如果都是如此实力的话……郑芝龙不敢多想，只是下令全军攻城。
此刻赤嵌城头的描难实叮见到400荷兰兵全军覆没，不禁眼前一黑，晕倒在城头。凰羽卫和郑军轻而易举的就拿下了这座守卫空虚的城市。期间有一个郑军兵士见到一个红毛鬼夷晕倒城头，悄悄四边无人注意，趁机挥刀割下了人头，拿去换赏。可怜描难实叮不明不白，便死在了小兵之手。
此战得胜之后，明军分兵扫清了各堡的残敌，集中兵力包围了台湾城。台湾百姓见王师强盛，乘势起义相助，除了台湾城外，其他各地的荷兰人都被百姓围杀。揆一收拢兵力，扼守台湾城，企图凭借火枪犀利和城堡坚固坚守台湾城等待巴达维亚来的援军。
台湾城长200多丈，高3丈多，分3层，下层深入地下1丈多，“城垣用糖水调灰垒砖，坚于石”。城四隅向外突出，置炮数十尊。郑军攻了几次，都被城头密集的炮火压制，一时只得退了下来。
媺娖下令从战舰上卸下火炮，在城外筑起高台，居高临下，压制城内炮火。当地百姓扶老携幼，纷纷相助。没几日炮台筑成，台湾城内顿成一片火海。揆一被流弹炸死，余下的荷兰军开城逃跑，却被凰羽卫堵住去路，几轮齐射后都做了枪下之鬼。
台湾本岛既然收复，按照大明的行政划分，应当由福建省管辖，媺娖便交给郑芝龙负责台湾防务，自己会合第三舰队前去迎战荷兰援军。
崇祯十六年六月，荷军海军指挥官雅科布率领一支由700人、10艘军舰组成的舰队向南中国海进发，他还不知道台湾已经被大明收复，正在焦急的赶往台湾城。
方到台湾海峡，雅克布就见到对面20艘巨舰挂着红底金龙旗成两列纵队向自己驶来。雅克布连忙下令己方舰队做好战斗准备。只是此时欧洲军舰还没有战列线战术的理念，荷兰军舰仍是凑成一团。
两军甫一交锋，荷军立刻就体会到明军纵队阵型的好处。明军的战舰数量本就是荷军的2倍，火炮数量更是在荷军3倍以上，这时成两列纵队将荷军夹在中间，从侧舷上肆无忌惮地宣泄着火力。荷军因为阵型的限制，本就有限的火力得不到充分发挥，没多久就败下阵来，
“厄克”号当即沉没，其他几艘军舰也被重创。
随着战局的推进，荷军的劣势越来越明显，已经是几艘明军军舰围观一艘荷军军舰了。雅科布见大势已去，只好降旗投降。明军带着俘获的5艘荷兰军舰驶回了台湾。
此战明军只有“经远”号1艘军舰受损较为严重，战后更是趁势攻占了荷兰人在硫球群岛的基地。琉球王本就是大明的藩属，见到明军来救，欢喜归附。
至此荷兰人在亚洲地区的主力舰队尽失，东亚海域彻底成为了大明大都督府海军司的后花园。
消息传回巴达维亚，荷兰当局惊恐万分。此时巴达维亚兵力空虚，荷军生怕明军会趁势攻来，决定封锁海域，加紧修筑炮台，以防万一。
好在数月之后明军派人辗转传来善意，要求荷兰人保障华商在东南亚的正当贸易安全，作为交换，大都督府也许可荷兰商人在东亚的正当贸易，巴达维亚总督闻讯后欣喜奉命不提。
自此，大明的海军实力深深震慑了荷兰当局，荷兰逐渐开始调整亚洲战略，谋求与大明的互利合作。
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